Riche de ses milieux naturels relativement bien préservés, la RNR des Marais des Trous de Leu abrite une grande diversité d'habitats.
De manière générale, les milieux boisés sont majoritaires et se répartissent en fonction de l'humidité : Chênaie-Charmaie dans les secteurs les moins humides et Aulnaie ou Saulaie pour les secteurs les plus humides. On retrouve aussi des milieux humides ouverts caractérisés par differents habitats de roselières.
Dans une moindre proportion, la Réserve abrite une prairie de fauche, ainsi que deux étendues d'eaux stagnantes : une mare et un étang .
Milieux boisés
Milieux humides ouverts
Prairie
Etendues d'eau
Quelques illustrations des milieux naturels retrouvés sur la Réserve :
